Add Typed TSV serialization
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319
SaneTsv.cs
319
SaneTsv.cs
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@ -28,6 +28,9 @@ public class SaneTsv
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COMMENTED_TSV = 2,
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}
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public static readonly byte[] TrueEncoded = Encoding.UTF8.GetBytes("TRUE");
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public static readonly byte[] FalseEncoded = Encoding.UTF8.GetBytes("FALSE");
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// TODO: We need to be able to update all these in tandem somehow
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public string[] ColumnNames { get; protected set; }
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public Type[] ColumnTypes { get; protected set; }
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@ -145,7 +148,8 @@ public class SaneTsv
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string columnTypeString;
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string columnName;
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if (columnString.Contains(':')) {
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if (columnString.Contains(':'))
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{
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if (format == FormatType.SIMPLE_TSV)
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{
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throw new Exception($"Header {fields.Count} contain ':', which is not allowed for column names");
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@ -507,7 +511,7 @@ public class SaneTsv
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// Serialize data
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for (int i = 0; i < data.Count; i++)
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{
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{
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for (int j = 0; j < data[i].Count; j++)
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{
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for (int k = 0; k < data[i][j].Length; k++)
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@ -548,6 +552,317 @@ public class SaneTsv
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return Encoding.UTF8.GetBytes(escapedString.ToString());
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}
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public static Type GetColumnFromType(Type type)
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{
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if (type == typeof(string))
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{
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return typeof(StringType);
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}
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else if (type == typeof(bool))
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{
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return typeof(BooleanType);
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}
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else if (type == typeof(float))
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{
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return typeof(Float32Type);
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}
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else if (type == typeof(double))
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{
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return typeof(Float64Type);
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}
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else if (type == typeof(UInt32))
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{
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return typeof(UInt32Type);
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}
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else if (type == typeof(UInt64))
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{
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return typeof(UInt64Type);
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}
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else if (type == typeof(Int32))
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{
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return typeof(Int32Type);
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}
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else if (type == typeof(Int64))
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{
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return typeof(Int64Type);
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}
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else if (type == typeof(byte[]))
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{
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return typeof(BinaryType);
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}
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else
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{
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throw new Exception($"Invalid type: {type}");
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}
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}
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public static string GetNameFromColumn(Type type)
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{
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if (type == typeof(StringType))
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{
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return "string";
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}
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else if (type == typeof(BooleanType))
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||||
{
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return "boolean";
|
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}
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else if (type == typeof(Float32Type))
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||||
{
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return "float32";
|
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}
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else if (type == typeof(Float32LEType))
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{
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return "float32-le";
|
||||
}
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else if (type == typeof(Float64Type))
|
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{
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||||
return "float64";
|
||||
}
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||||
else if (type == typeof(Float64LEType))
|
||||
{
|
||||
return "float64-le";
|
||||
}
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else if (type == typeof(UInt32Type))
|
||||
{
|
||||
return "uint32";
|
||||
}
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else if (type == typeof(UInt64Type))
|
||||
{
|
||||
return "uint64";
|
||||
}
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||||
else if (type == typeof(Int32Type))
|
||||
{
|
||||
return "int32";
|
||||
}
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else if (type == typeof(Int64Type))
|
||||
{
|
||||
return "int64";
|
||||
}
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else if (type == typeof(BinaryType))
|
||||
{
|
||||
return "binary";
|
||||
}
|
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else
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{
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throw new Exception($"Invalid type: {type}");
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}
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}
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public static byte[] SerializeTypedTsv(IList<Type> headerTypes, IList<string> headerNames, IList<IList<object>> data)
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{
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var bytes = new List<byte>();
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if (headerNames.Count != headerTypes.Count)
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{
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throw new ArgumentException($"headerTypes length ({headerTypes.Count}) does not match headerNames length ({headerNames.Count})");
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}
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// Serialize header
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for (int i = 0; i < headerNames.Count; i++)
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{
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for (int j = i + 1; j < headerNames.Count; j++)
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{
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if (headerNames[i] == headerNames[j])
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{
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throw new Exception("Column names in header must be unique");
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}
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}
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byte[] nameEncoded = Encoding.UTF8.GetBytes(headerNames[i]);
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for (int j = 0; j < nameEncoded.Length; j++)
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{
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if (nameEncoded[j] == '\n')
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{
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||||
bytes.Add((byte)'\\');
|
||||
bytes.Add((byte)'n');
|
||||
}
|
||||
else if (nameEncoded[j] == '\t')
|
||||
{
|
||||
bytes.Add((byte)'\\');
|
||||
bytes.Add((byte)'t');
|
||||
}
|
||||
else if (nameEncoded[j] == '\\')
|
||||
{
|
||||
bytes.Add((byte)'\\');
|
||||
bytes.Add((byte)'\\');
|
||||
}
|
||||
else if (nameEncoded[j] == '#')
|
||||
{
|
||||
bytes.Add((byte)'\\');
|
||||
bytes.Add((byte)'#');
|
||||
}
|
||||
else
|
||||
{
|
||||
bytes.Add(nameEncoded[j]);
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
bytes.Add((byte)':');
|
||||
try
|
||||
{
|
||||
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes(GetNameFromColumn(headerTypes[i])));
|
||||
}
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||||
catch (Exception e)
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{
|
||||
throw new Exception($"Invalid header type for column {i}", e);
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||||
}
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||||
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if (i == headerNames.Count - 1)
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||||
{
|
||||
bytes.Add((byte)'\n');
|
||||
}
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||||
else
|
||||
{
|
||||
bytes.Add((byte)'\t');
|
||||
}
|
||||
}
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||||
|
||||
// Serialize data
|
||||
for (int i = 0; i < data.Count; i++)
|
||||
{
|
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for (int j = 0; j < data[i].Count; j++)
|
||||
{
|
||||
try
|
||||
{
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||||
byte[] fieldEncoded;
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||||
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||||
if (headerTypes[j] == typeof(StringType))
|
||||
{
|
||||
fieldEncoded = Encoding.UTF8.GetBytes((string)data[i][j]);
|
||||
}
|
||||
else if (headerTypes[j] == typeof(BooleanType))
|
||||
{
|
||||
bytes.AddRange((bool)data[i][j] ? TrueEncoded : FalseEncoded);
|
||||
// In this case we know these values don't need escaping
|
||||
continue;
|
||||
}
|
||||
else if (headerTypes[j] == typeof(Float32Type))
|
||||
{
|
||||
// See https://learn.microsoft.com/en-us/dotnet/standard/base-types/standard-numeric-format-strings#round-trip-format-specifier-r
|
||||
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes(((float)data[i][j]).ToString("G9")));
|
||||
// In this case we know these values don't need escaping
|
||||
continue;
|
||||
}
|
||||
else if (headerTypes[j] == typeof(Float32LEType))
|
||||
{
|
||||
if (LittleEndian)
|
||||
{
|
||||
fieldEncoded = BitConverter.GetBytes((float)data[i][j]);
|
||||
}
|
||||
else
|
||||
{
|
||||
byte[] floatBytes = BitConverter.GetBytes((float)data[i][j]);
|
||||
fieldEncoded = new byte[sizeof(float)];
|
||||
for (int k = 0; k < sizeof(float); k++)
|
||||
{
|
||||
fieldEncoded[k] = floatBytes[sizeof(float) - 1 - k];
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
else if (headerTypes[j] == typeof(Float64Type))
|
||||
{
|
||||
// See https://learn.microsoft.com/en-us/dotnet/standard/base-types/standard-numeric-format-strings#round-trip-format-specifier-r
|
||||
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes(((double)data[i][j]).ToString("G17")));
|
||||
// In this case we know these values don't need escaping
|
||||
continue;
|
||||
}
|
||||
else if (headerTypes[j] == typeof(Float64LEType))
|
||||
{
|
||||
if (LittleEndian)
|
||||
{
|
||||
fieldEncoded = BitConverter.GetBytes((double)data[i][j]);
|
||||
}
|
||||
else
|
||||
{
|
||||
byte[] doubleBytes = BitConverter.GetBytes((double)data[i][j]);
|
||||
fieldEncoded = new byte[sizeof(double)];
|
||||
for (int k = 0; k < sizeof(double); k++)
|
||||
{
|
||||
fieldEncoded[k] = doubleBytes[sizeof(double) - 1 - k];
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
else if (headerTypes[j] == typeof(UInt32Type))
|
||||
{
|
||||
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes(((UInt32)data[i][j]).ToString()));
|
||||
// In this case we know these values don't need escaping
|
||||
continue;
|
||||
}
|
||||
else if (headerTypes[j] == typeof(UInt64Type))
|
||||
{
|
||||
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes(((UInt64)data[i][j]).ToString()));
|
||||
// In this case we know these values don't need escaping
|
||||
continue;
|
||||
}
|
||||
else if (headerTypes[j] == typeof(Int32Type))
|
||||
{
|
||||
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes(((Int32)data[i][j]).ToString()));
|
||||
// In this case we know these values don't need escaping
|
||||
continue;
|
||||
}
|
||||
else if (headerTypes[j] == typeof(Int64Type))
|
||||
{
|
||||
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes(((Int64)data[i][j]).ToString()));
|
||||
// In this case we know these values don't need escaping
|
||||
continue;
|
||||
}
|
||||
else if (headerTypes[j] == typeof(BinaryType))
|
||||
{
|
||||
fieldEncoded = (byte[])data[i][j];
|
||||
}
|
||||
else
|
||||
{
|
||||
throw new Exception($"Unexpected column type {headerTypes[j]} for column {j}");
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||||
}
|
||||
|
||||
for (int k = 0; k < fieldEncoded.Length; k++)
|
||||
{
|
||||
if (fieldEncoded[k] == '\n')
|
||||
{
|
||||
bytes.Add((byte)'\\');
|
||||
bytes.Add((byte)'n');
|
||||
}
|
||||
else if (fieldEncoded[k] == '\t')
|
||||
{
|
||||
bytes.Add((byte)'\\');
|
||||
bytes.Add((byte)'t');
|
||||
}
|
||||
else if (fieldEncoded[k] == '\\')
|
||||
{
|
||||
bytes.Add((byte)'\\');
|
||||
bytes.Add((byte)'\\');
|
||||
}
|
||||
else if (fieldEncoded[k] == '#')
|
||||
{
|
||||
bytes.Add((byte)'\\');
|
||||
bytes.Add((byte)'#');
|
||||
}
|
||||
else
|
||||
{
|
||||
bytes.Add(fieldEncoded[k]);
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
if (j == headerNames.Count - 1)
|
||||
{
|
||||
bytes.Add((byte)'\n');
|
||||
}
|
||||
else
|
||||
{
|
||||
bytes.Add((byte)'\t');
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
catch (InvalidCastException e)
|
||||
{
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throw new Exception($"Record {i}, field {j} expected type compatible with {GetNameFromColumn(headerTypes[j])}", e);
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}
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
|
||||
return bytes.ToArray();
|
||||
}
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||||
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||||
public SaneTsvRecord this[int i] => Records[i];
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||||
public class SaneTsvRecord
|
||||
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