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52ed949529
Author | SHA1 | Date | |
---|---|---|---|
|
52ed949529 | ||
|
dc0c300fdc |
@ -394,18 +394,42 @@ public class SaneTsv
|
|||||||
}
|
}
|
||||||
else if (parsed.ColumnTypes[j] == typeof(Float32Type))
|
else if (parsed.ColumnTypes[j] == typeof(Float32Type))
|
||||||
{
|
{
|
||||||
if (!float.TryParse(fieldString, out float parsedFloat))
|
float parsedFloat;
|
||||||
|
if (!float.TryParse(fieldString, out parsedFloat))
|
||||||
{
|
{
|
||||||
throw new Exception($"Field {j} on line {line} is not valid single-precision float");
|
if (fieldString == "-inf")
|
||||||
|
{
|
||||||
|
parsedFloat = float.NegativeInfinity;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
else if (fieldString == "+inf")
|
||||||
|
{
|
||||||
|
parsedFloat = float.PositiveInfinity;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
else
|
||||||
|
{
|
||||||
|
throw new Exception($"Field {j} on line {line} is not valid single-precision float");
|
||||||
|
}
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
|
||||||
parsedFields[j] = parsedFloat;
|
parsedFields[j] = parsedFloat;
|
||||||
}
|
}
|
||||||
else if (parsed.ColumnTypes[j] == typeof(Float64Type))
|
else if (parsed.ColumnTypes[j] == typeof(Float64Type))
|
||||||
{
|
{
|
||||||
if (!double.TryParse(fieldString, out double parsedDouble))
|
double parsedDouble;
|
||||||
|
if (!double.TryParse(fieldString, out parsedDouble))
|
||||||
{
|
{
|
||||||
throw new Exception($"Field {j} on line {line} is not valid double-precision float");
|
if (fieldString == "-inf")
|
||||||
|
{
|
||||||
|
parsedDouble = float.NegativeInfinity;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
else if (fieldString == "+inf")
|
||||||
|
{
|
||||||
|
parsedDouble = float.PositiveInfinity;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
else
|
||||||
|
{
|
||||||
|
throw new Exception($"Field {j} on line {line} is not valid double-precision float");
|
||||||
|
}
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
|
||||||
parsedFields[j] = parsedDouble;
|
parsedFields[j] = parsedDouble;
|
||||||
@ -725,7 +749,9 @@ public class SaneTsv
|
|||||||
{
|
{
|
||||||
try
|
try
|
||||||
{
|
{
|
||||||
byte[] fieldEncoded;
|
byte[] fieldEncoded = null;
|
||||||
|
// Some fields definitely don't need escaping, so we add them directly to bytes
|
||||||
|
bool skipEscaping = false;
|
||||||
|
|
||||||
if (headerTypes[j] == typeof(StringType))
|
if (headerTypes[j] == typeof(StringType))
|
||||||
{
|
{
|
||||||
@ -734,15 +760,31 @@ public class SaneTsv
|
|||||||
else if (headerTypes[j] == typeof(BooleanType))
|
else if (headerTypes[j] == typeof(BooleanType))
|
||||||
{
|
{
|
||||||
bytes.AddRange((bool)data[i][j] ? TrueEncoded : FalseEncoded);
|
bytes.AddRange((bool)data[i][j] ? TrueEncoded : FalseEncoded);
|
||||||
// In this case we know these values don't need escaping
|
skipEscaping = true;
|
||||||
continue;
|
|
||||||
}
|
}
|
||||||
else if (headerTypes[j] == typeof(Float32Type))
|
else if (headerTypes[j] == typeof(Float32Type))
|
||||||
{
|
{
|
||||||
// See https://learn.microsoft.com/en-us/dotnet/standard/base-types/standard-numeric-format-strings#round-trip-format-specifier-r
|
if (data[i][j] is float f)
|
||||||
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes(((float)data[i][j]).ToString("G9")));
|
{
|
||||||
// In this case we know these values don't need escaping
|
if (float.IsNegativeInfinity(f))
|
||||||
continue;
|
{
|
||||||
|
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes("-inf"));
|
||||||
|
}
|
||||||
|
else if (float.IsPositiveInfinity(f))
|
||||||
|
{
|
||||||
|
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes("+inf"));
|
||||||
|
}
|
||||||
|
else
|
||||||
|
{
|
||||||
|
// See https://learn.microsoft.com/en-us/dotnet/standard/base-types/standard-numeric-format-strings#round-trip-format-specifier-r
|
||||||
|
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes(((float)data[i][j]).ToString("G9")));
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
else
|
||||||
|
{
|
||||||
|
throw new InvalidCastException();
|
||||||
|
}
|
||||||
|
skipEscaping = true;
|
||||||
}
|
}
|
||||||
else if (headerTypes[j] == typeof(Float32LEType))
|
else if (headerTypes[j] == typeof(Float32LEType))
|
||||||
{
|
{
|
||||||
@ -762,10 +804,27 @@ public class SaneTsv
|
|||||||
}
|
}
|
||||||
else if (headerTypes[j] == typeof(Float64Type))
|
else if (headerTypes[j] == typeof(Float64Type))
|
||||||
{
|
{
|
||||||
// See https://learn.microsoft.com/en-us/dotnet/standard/base-types/standard-numeric-format-strings#round-trip-format-specifier-r
|
if (data[i][j] is double d)
|
||||||
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes(((double)data[i][j]).ToString("G17")));
|
{
|
||||||
// In this case we know these values don't need escaping
|
if (double.IsNegativeInfinity(d))
|
||||||
continue;
|
{
|
||||||
|
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes("-inf"));
|
||||||
|
}
|
||||||
|
else if (double.IsPositiveInfinity(d))
|
||||||
|
{
|
||||||
|
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes("+inf"));
|
||||||
|
}
|
||||||
|
else
|
||||||
|
{
|
||||||
|
// See https://learn.microsoft.com/en-us/dotnet/standard/base-types/standard-numeric-format-strings#round-trip-format-specifier-r
|
||||||
|
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes((d).ToString("G17")));
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
else
|
||||||
|
{
|
||||||
|
throw new InvalidCastException();
|
||||||
|
}
|
||||||
|
skipEscaping = true;
|
||||||
}
|
}
|
||||||
else if (headerTypes[j] == typeof(Float64LEType))
|
else if (headerTypes[j] == typeof(Float64LEType))
|
||||||
{
|
{
|
||||||
@ -785,27 +844,23 @@ public class SaneTsv
|
|||||||
}
|
}
|
||||||
else if (headerTypes[j] == typeof(UInt32Type))
|
else if (headerTypes[j] == typeof(UInt32Type))
|
||||||
{
|
{
|
||||||
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes(((UInt32)data[i][j]).ToString()));
|
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes(((UInt32)(int)data[i][j]).ToString()));
|
||||||
// In this case we know these values don't need escaping
|
skipEscaping = true;
|
||||||
continue;
|
|
||||||
}
|
}
|
||||||
else if (headerTypes[j] == typeof(UInt64Type))
|
else if (headerTypes[j] == typeof(UInt64Type))
|
||||||
{
|
{
|
||||||
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes(((UInt64)data[i][j]).ToString()));
|
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes(((UInt64)(int)data[i][j]).ToString()));
|
||||||
// In this case we know these values don't need escaping
|
skipEscaping = true;
|
||||||
continue;
|
|
||||||
}
|
}
|
||||||
else if (headerTypes[j] == typeof(Int32Type))
|
else if (headerTypes[j] == typeof(Int32Type))
|
||||||
{
|
{
|
||||||
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes(((Int32)data[i][j]).ToString()));
|
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes(((Int32)(int)data[i][j]).ToString()));
|
||||||
// In this case we know these values don't need escaping
|
skipEscaping = true;
|
||||||
continue;
|
|
||||||
}
|
}
|
||||||
else if (headerTypes[j] == typeof(Int64Type))
|
else if (headerTypes[j] == typeof(Int64Type))
|
||||||
{
|
{
|
||||||
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes(((Int64)data[i][j]).ToString()));
|
bytes.AddRange(Encoding.UTF8.GetBytes(((Int64)(int)data[i][j]).ToString()));
|
||||||
// In this case we know these values don't need escaping
|
skipEscaping = true;
|
||||||
continue;
|
|
||||||
}
|
}
|
||||||
else if (headerTypes[j] == typeof(BinaryType))
|
else if (headerTypes[j] == typeof(BinaryType))
|
||||||
{
|
{
|
||||||
@ -816,42 +871,45 @@ public class SaneTsv
|
|||||||
throw new Exception($"Unexpected column type {headerTypes[j]} for column {j}");
|
throw new Exception($"Unexpected column type {headerTypes[j]} for column {j}");
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
|
||||||
for (int k = 0; k < fieldEncoded.Length; k++)
|
if (!skipEscaping)
|
||||||
{
|
{
|
||||||
if (fieldEncoded[k] == '\n')
|
for (int k = 0; k < fieldEncoded.Length; k++)
|
||||||
{
|
{
|
||||||
bytes.Add((byte)'\\');
|
if (fieldEncoded[k] == '\n')
|
||||||
bytes.Add((byte)'n');
|
{
|
||||||
}
|
bytes.Add((byte)'\\');
|
||||||
else if (fieldEncoded[k] == '\t')
|
bytes.Add((byte)'n');
|
||||||
{
|
}
|
||||||
bytes.Add((byte)'\\');
|
else if (fieldEncoded[k] == '\t')
|
||||||
bytes.Add((byte)'t');
|
{
|
||||||
}
|
bytes.Add((byte)'\\');
|
||||||
else if (fieldEncoded[k] == '\\')
|
bytes.Add((byte)'t');
|
||||||
{
|
}
|
||||||
bytes.Add((byte)'\\');
|
else if (fieldEncoded[k] == '\\')
|
||||||
bytes.Add((byte)'\\');
|
{
|
||||||
}
|
bytes.Add((byte)'\\');
|
||||||
else if (fieldEncoded[k] == '#')
|
bytes.Add((byte)'\\');
|
||||||
{
|
}
|
||||||
bytes.Add((byte)'\\');
|
else if (fieldEncoded[k] == '#')
|
||||||
bytes.Add((byte)'#');
|
{
|
||||||
}
|
bytes.Add((byte)'\\');
|
||||||
else
|
bytes.Add((byte)'#');
|
||||||
{
|
}
|
||||||
bytes.Add(fieldEncoded[k]);
|
else
|
||||||
|
{
|
||||||
|
bytes.Add(fieldEncoded[k]);
|
||||||
|
}
|
||||||
}
|
}
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
|
||||||
if (j == headerNames.Count - 1)
|
if (j < data[i].Count - 1)
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||||||
{
|
|
||||||
bytes.Add((byte)'\n');
|
|
||||||
}
|
|
||||||
else
|
|
||||||
{
|
{
|
||||||
bytes.Add((byte)'\t');
|
bytes.Add((byte)'\t');
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
else if (i < data.Count - 1)
|
||||||
|
{
|
||||||
|
bytes.Add((byte)'\n');
|
||||||
|
}
|
||||||
}
|
}
|
||||||
catch (InvalidCastException e)
|
catch (InvalidCastException e)
|
||||||
{
|
{
|
||||||
|
@ -1,5 +1,4 @@
|
|||||||
using NathanMcRae;
|
using NathanMcRae;
|
||||||
using System.Linq;
|
|
||||||
using System.Text;
|
using System.Text;
|
||||||
|
|
||||||
{
|
{
|
||||||
@ -89,5 +88,58 @@ using System.Text;
|
|||||||
|
|
||||||
Console.WriteLine("Done with tests");
|
Console.WriteLine("Done with tests");
|
||||||
|
|
||||||
|
{
|
||||||
|
string testName = "Serde test";
|
||||||
|
string[] headerNames =
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"string-test",
|
||||||
|
"bool-test",
|
||||||
|
"float32-test",
|
||||||
|
"float32-le-test",
|
||||||
|
"float64-test",
|
||||||
|
"float64-le-test",
|
||||||
|
"uint32-test",
|
||||||
|
"uint64-test",
|
||||||
|
"int32-test",
|
||||||
|
"int64-test",
|
||||||
|
"binary-test",
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
Type[] headerTypes =
|
||||||
|
{
|
||||||
|
typeof(SaneTsv.StringType),
|
||||||
|
typeof(SaneTsv.BooleanType),
|
||||||
|
typeof(SaneTsv.Float32Type),
|
||||||
|
typeof(SaneTsv.Float32LEType),
|
||||||
|
typeof(SaneTsv.Float64Type),
|
||||||
|
typeof(SaneTsv.Float64LEType),
|
||||||
|
typeof(SaneTsv.UInt32Type),
|
||||||
|
typeof(SaneTsv.UInt64Type),
|
||||||
|
typeof(SaneTsv.Int32Type),
|
||||||
|
typeof(SaneTsv.Int64Type),
|
||||||
|
typeof(SaneTsv.BinaryType),
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
object[][] data =
|
||||||
|
{
|
||||||
|
new object[] { "test", true, 44.5f, 44.5f, -88e-3, -88e-3, 7773, 88888888, -7773, -88888888, new byte[] { 0, 1, 2, 3 } },
|
||||||
|
new object[] { "test2", false, 44.5000005f, 44.5000005f, -88e-30, -88e-30, 7773, 88888888, -7773, -88888888, new byte[] { 0, 1, 2, 3, 4 } },
|
||||||
|
new object[] { "test2", false, float.NaN, float.NaN, double.NaN, double.NaN, 7773, 88888888, -7773, -88888888, new byte[] { 0, 1, 2, 3, 4 } },
|
||||||
|
new object[] { "test2", false, float.NegativeInfinity, float.NegativeInfinity, double.NegativeInfinity, double.NegativeInfinity, 7773, 88888888, -7773, -88888888, new byte[] { 0, 1, 2, 3, 4 } },
|
||||||
|
new object[] { "test2", false, float.PositiveInfinity, float.PositiveInfinity, double.PositiveInfinity, double.PositiveInfinity, 7773, 88888888, -7773, -88888888, new byte[] { 0, 1, 2, 3, 4 } },
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
byte[] serialized = SaneTsv.SerializeTypedTsv(headerTypes, headerNames, data);
|
||||||
|
|
||||||
|
SaneTsv parsed = SaneTsv.ParseTypedTsv(serialized);
|
||||||
|
|
||||||
|
if ((float)parsed.Records[1]["float32-test"] == 44.5000005)
|
||||||
|
{
|
||||||
|
Console.WriteLine($"Passed {testName}");
|
||||||
|
}
|
||||||
|
else
|
||||||
|
{
|
||||||
|
Console.WriteLine($"Failed {testName}");
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
// TODO: Check qNaN, sNaN, +inf, -inf values for float types
|
// TODO: Check qNaN, sNaN, +inf, -inf values for float types
|
||||||
|
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